Game lấy bối cảnh tại hành tinh Nu Earth, nơi có vị trí chiến lược rất quan trọng là gần một lỗ đen – cổng dịch chuyển đến những hành tinh khác trong vũ trụ. Vì lý do này nên Nu Earth đã bị các thế lực xâu xé, mưu đồ giành quyền bá chủ. Chiến tranh nổ ra và Nu Earth chỉ còn là một hành tinh hoang tàn với môi trường bị ô nhiễm nặng nề. Lúc này, các nhà khoa học thuộc phe Souther đã phát triển thành công một giống người vô tình có sức mạnh phi thường và khả năng chịu đựng cao. Họ có thể sinh sống trong môi trường khắc nghiệt tại Nu Earth mà không cần bất cứ dụng cụ bảo vệ nào (trong khi con người bình thường phải trang bị áo giáp và bình dưỡng khí mới tồntại được). Giống người siêu phàm có nước da xanh xám và đôi mắt trắng dã này, được tập hợp thành một đội quân với tên gọi GI (Genetic Infantrymen – Chiến binh đột biến gien). Đây là lực lượng nòng cốt của phe Souther. Rogue, nhân vật chính trong game, là một chiến binh thuộc đội quân của Souther kể từ đây phải dấn thân vào cuộc chiến tranh ác liệt giữa Souther và Nort trên Nu Earth.[2]